Uno dei modi migliori per visitare le bellezze naturali della marina di Porto Cesareo, oltre al trekking, è sicuramente via mare.
In tutto il paese è facile trovare dei negozi di noleggio canoe, barche e per i clienti più esigenti è possibile prenotare delle escursioni in barca con aperitivo al tramonto prima del ritorno nel porto.
Via mare, Porto Cesareo, si apre ad un'ampia scelta di posti da scoprire; dall'isola dei conigli e all'isola della Malva, ideale per fare snorkeling e ammirare il molo sommerso ricco di anfore e di colonne greco-romane.
La navigazione generalmente prosegue fino a Torre Lapillo dove ci sarà possibile effettuare alre due immersioni e un aperitivo di prodotti tipici pugliesi, offerto dal Capitano.